El 15 de diciembre de 2005, se inauguró el Museo Etnográfico de la Universidad del Magdalena, fecha desde la cual ha venido funcionando en el segundo piso del edificio del antiguo Hospital San Juan de Dios, declarado como Bien de Interés Cultural el 16 de abril de 1999. El museo es el producto de la materialización de las políticas culturales de la Rectoría y de la Vicerrectoria de Extensión de la Universidad del Magdalena donde a través de sus tres salas permanentes y una temporal, las cuales son un aporte al fortalecimiento del arraigo y la identidad cultural de Santa Marta, y la Región Caribe colombiana. Hoy en día, el Museo Etnográfico ofrece a sus visitantes la oportunidad más importante para apreciar el reflejo de esta pluralidad étnica, cultural e histórica de la ciudad, del departamento y la región.

El Museo Etnográfico cuenta en la actualidad con tres (3) salas permanentes:

o Sala I. "Al vaivén de las olas del Mar Caribe y el Río Grande de la Magdalena",